国产高端实验室科学仪器之十七AD16

年全国科技工作者日座谈会,北京航空航天大学研究生院常务副院长赵巍胜说:依赖进口科学仪器就是空中建楼阁,他特别提出大力推进科学仪器自主可控,实现科技自立自强的建议。赵巍胜副院长倡议:把国产设备使用率作为申请国家项目的一个核心申请指标。因为,今天我们依赖进口设备其实就是在空中建楼阁,随时都可能坍塌。他建议,以全社会力量推进国产科研仪器的使用。

赵巍胜指出,要明确创新争先路径,加强基础研究,实现原始创新突破;大力推进科学仪器自主可控,实现科技自立自强;加强国际合作,与国际科技友军互惠互赢。

为此实验猫将分多期推荐“重大科研基础设施和大型科研仪器国家网络管理平台”中高端国产仪器,本期为第17期,领航基因科技AD16全自动微滴数字PCR仪:

AD16全自动微滴数字PCR仪

技术指标:

采用压力动力产生油包水微滴,非纳米孔固态分区;

CMOS检测器,无需掺入额外本底荧光即可识别阴性微滴;

≤0.1%,能检测到单拷贝基因;

在一台设备上实现全自动微滴生成、PCR扩增、多通道荧光检测分析,从样本进到结果出实现无人值守;

样品放入样本制备仪后全程无需人工移取微滴,封闭体系设计确保P产物不暴露在空气中,减少气溶胶污染和样品损失;

不少于7色荧光检测通道;

能完成机器操控和数据分析的一体化操作。软件能够进行绝对定量分析,以及拷贝数变异分析,支持手动或自动划分阈值线,每个样本可单独设定阈值或者多样本并行划分阈值。

产品介绍:

数字PCR是第三代PCR技术,其技术原理是通过将反应体系分散到成千上万的反应单元中,进行单分子级别的平行扩增。扩增结束后,根据阳性反应单元和总反应单元的数目,结合泊松分布原理,从而实现核酸靶标的绝对定量。该项技术具有高灵敏度、高特异性、高耐受性和绝对定量的特点。数字P仪在生命科学研究及临床应用领域有诸多应用,如基因组变异检测(单碱基核酸多态性分析SNP/SNV)、基因表达精细分析,miRNA检测及其前体表达量鉴定、拷贝数变异(CNV)分析鉴定、线粒体突变检测、融合基因(转基因组分)表达鉴定及转录因子绝对定量、单细胞基因表达分析、DNA甲基化定量检测、转基因组分(GMO)含量检测、第二代测序(NGS)文库的绝对定量等。

目前国际上富鲁达(Fluidigm)、赛默飞(ThermoFisher)、伯乐(Bio-Rad)和StillaTechnologies公司的数字P产品均实现了商业化应用。国内一些企业也纷纷加入数字P研发领域,自主研发数字PCR仪器。

领航基因科技(杭州)有限公司成立于年,专注于高端数字PCR设备、配套耗材与试剂的研发。该公司自主研发的AD16全自动微滴数字PCR仪具有以下创新点:

(1)具有7色荧光通道;

(2)集液滴生成、扩增反应、芯片分析和结果输出一体化;

(3)采用独特专利技术的微滴生成原理,可以对DNA/RNA分子采用绝对定量的方式进行分析,不需要标准曲线。

AD16全自动微滴数字PCR仪先后获得“浙江省重点研发计划—高端体外诊断检验仪器及试剂研发-新型全自动数字PCR病原诊断系统研发及临床应用”、“中国医科院临床与转化研究基金重点项目—基于新型高通量数字式PCR平台研制多种呼吸道病原体检测试剂”、“上海市科技创新行动计划医学创新研究专项面上项目—数字PCR用于血液肿瘤患者真菌感染的快速检测及辅助指导卡泊芬净使用的研究”等项目支持。

目前AD16全自动微滴数字PCR仪已被南京海关、医院、医院、医院,厦门大学分子诊断教育部工程研究中心、北京疾病控制中心、中国农科院作物科学研究所等50余家单位采用。

应用案例:

(1)浙江大学医院利用AD16全自动微滴数字P系统开展SATB2相关综合征(SATB2-associatedsyndromeSAS)罕见病基因定量检测。

(2)医院基于AD16全自动微滴数字PCR系统开展血流感染患者的应用研究。

(3)医院基于AD16全自动微滴数字P系统开展新冠病毒定量检测及新冠患者治疗康复中的应用研究。

(4)上海交通大医院基于AD16全自动微滴数字PCR系统开展TSC2基因低比例突变嵌合体基因学分析研究。

(5)中国医科院医院基于AD16全自动微滴数字PCR系统开展心内膜感染中的应用研究。

(6)中国农业科学院作物科学研究所基于AD16全自动微滴数字PCR系统开展转基因小麦表达检测。

支撑项目:

(1)微滴式数字PCR病原体精准诊断技术应用于脓毒症患者救治中的效能分析——上海市科技创新行动计划医学创新研究专项面上项目,医院张文宏团队。

(2)数字PCR血流感染检测用于血液肿瘤感染患者中快速诊断及辅助治疗的研究——上海市卫生健康委员会科研课题,医院李军民团队。(3)新型冠状病毒高灵敏检测试剂盒的研发和临床运用——台州疫情应急重大项目,年医院沈波团队。

(4)高端体外诊断检验仪器及试剂研发-新型全自动数字P病原诊断系统研发及临床应用——浙江省重点研发计划,年浙医院俞云松团队。

(5)基于数字PCR技术的急危重症患者血流感染早期诊断和病情监控的研究——四川省科技厅项目,年医院应斌武团队。

(6)血流感染致病菌快速诊断、动态监控与精准治疗新方案研究——浙江省重点研发计划,年血流感染致病菌快速诊断、动态监控与精准治疗新方案研究。

(7)单基因遗传病无创产前诊断技术研发及临床应用研究——浙江省重点研发计划,年浙江大学医院董旻岳团队。

发表论文:

[1]QianY,LiuJ,YangY,etal.PaternalLow-LevelMosaicism-CausedSATB2-AssociatedSyndrome.FrontiersinGenetics,,10.

[2]ZhouF,SunS,SunX,etal.RapidandsensitiveidentificationofpleuralandperitonealinfectionsbydropletdigitalPCR.FoliaMicrobiologica,,66(2):-.

[3]LiuC,ShiQ,PengM,etal.EvaluationofdropletdigitalPCRforquantificationofSARS-CoV-2VirusindischargedCOVID-19patients.Aging,,12(21):-.

[4]HuB,TaoY,ShaoZ,etal.AComparisonofBloodPathogenDetectionAmongDropletDigitalPCR,MetagenomicNext-GenerationSequencing,andBloodCultureinCriticallyIllPatientsWithSuspectedBloodstreamInfections.FrontMicrobiol.,12:.

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